中心碳代谢途径(三羧酸循环、糖酵解、磷酸戊糖途径)

中心碳代谢 (CCM) 途径相关代谢物包括葡萄糖参与的三羧酸循环 (TCA)、糖酵解途径 (EMP) 以及磷酸戊糖途径 (PPP) 等途径中的几十种代谢物。

]中心碳代谢

中心碳代谢 (CCM) 传统意义上包括糖酵解途径 (EMP)、磷酸戊糖途径 (PPP) 以及三羧酸循环 (TCA),中心碳代谢是生物体所需 能量的主要来源,并为体内其他代谢提供前体物质。氧化还原反应是主要的化学反应之一,而氧化还原酶是负责催化这些反应的酶。 在三羧酸循环、磷酸戊糖途径等代谢途径中,氧化还原酶起着关键酶的作用。 葡萄糖是最重要的能源物质,起到氧化供能(主要功能)、为脂类和蛋白质的合成提供所需要的碳源、组成糖脂等生理功能, 其在生物体内的分解途径主要为中心碳代谢。葡萄糖代谢异常时,可引发机体各种疾病,如糖尿病及其并发症。此外蚕豆病、糖尿 病状动脉硬化性心脏病、妊娠糖代谢异常和肝病等疾病的发生也与糖代谢异常密切相关。而乳酸和丙酮酸异常则很可能与糖酵解途 径有关。其他糖酵解途径的一些代谢中间体也为脂类、氨基酸及其他一些生物合成提供了前体和原料。此外,细胞主要进行无氧呼 吸而非正常的有氧氧化则是鉴别是否有肿瘤的一个重要因素。

]服务流程

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]样本量要求

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]生物学重复

相较于其他组学,代谢组学更加灵敏,更接近于真实情况。因此,为保证实验结果的可靠性,要求更多的生物学样本重复。我们建议:

临床样本,单组不少于30 例重复;

动物样本,单组不少于9 例重复;

细胞、微生物样本,单组不少于5 例重复;

其他如植物样本,单组不少于7 例重复。

]仪器平台



平台一:超高效液相色谱串联质谱联用仪 1290-6470( Agilent UHPLC-MS/MS)


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灵敏度更高 — 低至亚飞克级的检测限更清晰的信号和更低的噪音 — 安捷伦喷射流技术采用超热氮气

改善离子生成与脱溶剂。可灵活升级为 Agilent iFunnel 技术的安全投资通过弯曲的圆锥形六极杆创新组

件进行产物离子的高效采集和传输筛查、确证和定量 — 触发式多反应监测 (tMRM) 结合了快速、灵敏

的 MRM 定量分析与产物离子谱图,可用于谱库检索、化合物筛查和确证。



平台二:超高效液相色谱串联质谱联用仪 Triple Quad® 5500 系统 ( Waters UPLC-AB Sciex MS/MS)

仪器2.jpgACQUITY UPLC 系统不断为世界各地的实验室设立新的基准。UPLC 分离度和灵敏度使科学家们能够鉴

定出复杂生物样本中按量极低的化合物。Triple Quad 5500 LC-MS/MS 系统专为提供高级别灵敏度和耐

用性而设计,即便面对最复杂、要求最严苛的基质也游刃有余。在环境、靶向定量、临床研究、食品和

饮料应用所需的多组分定量分析方面表现卓越。



平台三:超高效液相色谱高分辨质谱联用仪 Q Exactive ™ ( Thermo Scientific Orbitrap MS)

图片关键词搭配 UltiMate ™ 3000 系统,使用 Q Exactive ™ 组合型四极杆 Orbitrap 质谱仪可以快速可靠地识别、

定量和确认更多化合物。 本台式 UHPLC-HRMS 系统将四极杆母离子选择性与高分辨率和准确质量数

(HRAM)Orbitrap 检测相结合,提供出色性能和多功能性。 Q Exactive 质谱仪特别适用于非目标或目

标化合物筛查,也能够实现广泛的定性和定量应用。



平台四:气相色谱质谱联用仪(GC-MS)7890A/5975C(Agilent GC-MS)

图片关键词气相色谱 - 质谱与生俱来的定量准确性 ( 无液相色谱 - 质谱联用平台常用的电喷雾离子化所存在的基质

抑制效应 )、超高的稳定性和易用性,以及不俗的灵敏度和高通量,能胜任多数代谢组学和基础生命科

学研究任务。尤其是那些浓度较高、具有挥发性的物质或虽具有亲水性但衍生后具有挥发性的代谢物,

如脂肪酸、糖酵解和三羧酸循环相关代谢物、氨基酸和中长链脂肪酸等,都十分适用。



]服务周期

样本检测:15-25 个工作日;

数据分析:5-15 个工作日;

服务周期自收到预付款、待测样本和客户确认检测要求之日起计算。


]应用方向

表型组和生理功能研究;

临床早期预测、诊疗研究;

病理学研究 ;

天然药物和药理研究 ;

中医现代化和理论研究;

食品科学、安全和营养学研究;

畜牧业和农林业研究;

植物学和环境研究;

毒理学研究。






定量物质


]三羧酸循环(TCA cycle)途径

NoMetabolite中文名CAS号ClassHMDB ID
1Citric acid柠檬酸77-92-9三羧酸循环(TCA)HMDB0000094
2cis-Aconitic acid顺乌头酸585-84-2三羧酸循环(TCA)HMDB0000072
3Isocitric acid异柠檬酸320-77-4三羧酸循环(TCA)HMDB0000193
42-Ketoglutaric acidα-酮戊二酸328-50-7三羧酸循环(TCA)HMDB0000208
5Succinic acid琥珀酸110-15-6三羧酸循环(TCA)HMDB0000254
6Fumaric acid延胡索酸110-17-8三羧酸循环(TCA)HMDB0000134
7Malic acid苹果酸97-67-6三羧酸循环(TCA)HMDB0000744
8Oxalacetic acid草酰乙酸328-42-7三羧酸循环(TCA)HMDB0000223


]糖酵解(Glycolysis)途径

NoMetabolite中文名CAS号ClassHMDB ID
1D-Glucose葡萄糖492-61-5糖酵解(Glycolysis)HMDB0000122
2Glucose 6-phosphate葡萄糖-6-磷酸56-73-5糖酵解(Glycolysis)HMDB0001401
3Fructose 6-phosphate果糖-6-磷酸643-13-0糖酵解(Glycolysis)HMDB0000124
4Fructose 1,6-bisphosphate果糖-1,6-二磷酸34693-15-7糖酵解(Glycolysis)HMDB0001058
5Glyceraldehyde 3-phosphate甘油醛-3-磷酸591-57-1糖酵解(Glycolysis)HMDB0001112
6Dihydroxyacetone phosphate磷酸二羟丙酮57-04-5糖酵解(Glycolysis)HMDB0001473
73-Phosphoglyceric acid3-磷酸甘油酸299804糖酵解(Glycolysis)HMDB0000807
82-Phosphoglyceric acid2-磷酸甘油酸2553-59-5糖酵解(Glycolysis)HMDB0000362
9Phosphoenolpyruvic acid磷酸烯醇式丙酮酸50625糖酵解(Glycolysis)HMDB0000263
10Pyruvic acid丙酮酸127-17-3糖酵解(Glycolysis)HMDB0000243
11L-Lactic acid乳酸79-33-4糖酵解(Glycolysis)HMDB0000190
12Acetyl-CoA乙酰辅酶A72-89-9糖酵解(Glycolysis)HMDB0001206


]
磷酸戊糖 (PP) 途径

NoMetabolite中文名CAS号ClassHMDB ID
16-Phosphogluconic acid葡萄糖酸-6-磷酸921-62-0戊糖磷酸途径(PPP)HMDB0001316
2Erythrose 4-phosphate赤藓糖-4-磷酸585-18-2戊糖磷酸途径(PPP)HMDB0001321
3Ribose 5-phosphate核糖-5-磷酸4300-28-1戊糖磷酸途径(PPP)HMDB0001548
4Ribulose 5-phosphate核酮糖-5-磷酸4151-19-3戊糖磷酸途径(PPP)HMDB0000618
5Xylulose 5-phosphate木酮糖-5-磷酸4212-65-1戊糖磷酸途径(PPP)HMDB0000868
6Sedoheptulose 7-phosphate景天庚酮糖-7-磷酸2646-35-7戊糖磷酸途径(PPP)HMDB0001068




服务示例






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部分糖代谢中间产物XIC图

从上图我们看出F6P、G6P、F1P、G1P保留时间非常接近,很难将其分离。谱领生物在方法上不断优化,终于达到将其进行分离的目的,称得上为国内首屈一指的代谢组学服务的领先品牌。

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F6P、G6P、F1P、G1P分离实例







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部分糖类物质TIC图

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部分糖类物质标准曲线参考

No.Metaboliteslinear range(ug/ml)R2RSD(%,n=6)
1Lyxose0.02-0.50.999693.86
2Trehalose0.02-0.50.999245.97
3
Mannose0.02-2
0.99942
9.05
4Lactic acid0.02-20.999468.63
5Inositol0.5-200.999674.37
6Citric acid2-1000.999039.69
7Fructose10-2000.999036.54

部分糖类物质测定参数参考





文献案例



  • Metabolic profiling by gas chromatographymass spectrometry of energymetabolism in high-fat diet-fed obese mice. Plos One.2017.


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