转录组测序

转录组测序 

转录组测序(RNA-Seq)的研究对象是特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有mRNA的总和。新一代高通量测序技术能够全面快速的获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息,从而准确地分析基因表达差异、基因结构变异、筛选分子标记(SNPs或SSR)等生命科学重要问题。



我们的优势


 无便向性,适用于各类型样本;

不局限于模式物种,可研究非模式物种,针对不同平台的数据,制定多套定制化流程;

整合多个转录组相关数据库,从本质上提高后期分析的广度和精度;

个性化定制分析,让您的文章脱颖而出。



样本量要求


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测序分类


单细胞转录组测序;

全转录组测序;

mRNA测序;

microRNA测序;

lncRNA测序;

circRNA测序;

RNA相对表达量qPCR检测。



实验流程


  1. 客户样本:保证细胞量在106个以上,否则则需风险建库;

  2. RNA提取:经典试剂盒快速提取法;

  3. RNA质控:凝胶电泳质控→Nanodrop质控→Agilent 2200质控;

  4. 文库构建:polyA建库;

  5. 上机测序:建议选择NovaSeq测序平台,双端测序,通量大,碱基精度高,且成本低,速度快。推荐数据量:6Gb。



文献案例


  • Ju L, Han J, Zhang X, et al. Obesity-associated inflammation triggers an autophagy-lysosomal response in adipocytes and causes degradation of perilipin 1. Cell Death Dis. 2019 Feb 11;10(2):121. 

  • He H, Chen E, Lei L, et al. Alteration of the tumour suppressor SARDH in sporadic colorectal cancer: a functional and transcriptome profiling-based study. Mol Carcinog. 2019 Jan 29.






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