微生物群落（菌群多样性组成谱）测序是指以细菌/古菌16S rRNA基因可变区、真菌18S rRNA基因可变区或真菌ITS（Internal transcribed spacer）内转录间隔区等微生物特征序列（Signature sequence）为靶点对微生物群体进行高通量测序，通过分析测序序列的结构（数量、丰度、种类、变异等）来分析特定环境中微生物群体中各类微生物的构成情况或其功能。
继而我们可以研究、分析微生物与环境因素或宿主之间的关系，寻找标志性菌群或特定功能的基因，阐明样本间多样性和组成差异，进而发现差异相关物种。
对微生物群落进行测序包括两类：
1. 通过16s rDNA，18s rDNA，ITS区域进行扩增测序分析微生物的群体构成和多样性；
2. 宏基因组测序，是不经过分离培养微生物，而对所有微生物DNA进行测序，从而分析微生物群落构成，基因构成，挖掘有应用价值的基因资源。
以16s rDNA扩增进行测序分析主要用于微生物群落多样性和构成的分析，目前的生物信息学分析也可以基于16s rDNA的测序对微生物群落的基因构成和代谢途径进行预测分析，大大拓展了我们对于环境微生物的微生态认知。
谱领生物可根据16s的测序数据结果结合已有知识将微生物群落分类到种（species）甚至对亚种级别并进行分析。
服 务 优 势
♕ 丰富的样本制备经验：针对粪便、土壤、拭子等三十余种样本有相应的试剂盒进行提取；
♕ 读长长，项目周期短；
♕ 定制化分析策略：根据客户要求，可定制化分析ROC曲线、Source Tracker分析、Mantel test分析等。
微生物与环境研究；
微生物多样性研究；
物生物种群数量研究；
优势种研究；
微生物功能预测。
服 务 流 程
DNA样品总量：单次建库的量 m ≥ 250ng，建议送两次建库的量 m ≥ 500ng；
DNA样品浓度：c ≥ 5ng/μL；
DNA样品纯度：260/280在1.8-2.0之间；
DNA样品完整性：DNA无降解，即电泳有明显的主带。
检测平台：
采用 Ion S5 XL 测序平台和 NovaSeq 6000 测序平台。NovaSeq 6000 测序平台通量更高，速度更快，运行时间更短，周期最短可达10天。Ion S5 XL测序平台单端测序，无需拼接，SE400/SE600 两种模式。两种平台，为扩增子测序提供更多的选择。
测序深度：
PE 250 / SE400/600
服务周期：
10个工作日
物种丰度柱形图
物种丰度聚类热图
主成分分析
LEfSe分析
Spearman关联分析
PICRUSt分析
典 型 案 例
Tfh细胞通过识别细菌产生的胞外ATP以促进形成有益于宿主代谢稳态的肠道生态系统
T Follicular Helper Cells Promote a Beneficial Gut Ecosystem for Host Metabolic Homeostasis by Sensing Microbiota-Derived Extracellular ATP
期刊：Cell Reports
影响因子：8.28
发表单位：Institute for Research in Biomedicine, Universita` della Svizzera Italiana
发表时间：2017.03
哺乳动物的肠道微生物能调节宿主的脂肪存储，研究表明肠道中的Tfh细胞能控制IgA的分泌，缺乏P2X7的小鼠导致IgA分泌增加，本文是在缺乏P2X7的小鼠基础上，研究肠道微生物以及代 谢情况。
研究过程
研究结果
1. 缺失P2X7的小鼠体重和微生物变化
P2rx7-/-小鼠的体重增加和葡萄糖代谢受损；P2rx7-/-小鼠改变了肠道的微生物， 且富集了Lachnospiraceae（与肥胖有关）和Helicobacteraceae，P2rx7-/-小 鼠中与肥胖相关的短链脂肪酸(SCFAs)也增加。
2. Tfh细胞调节葡萄糖代谢和微生物组成
通过测定WT和P2rx7-/-中Tfh细胞转移到Cd3e-/-小鼠，万古霉素、氨苄西林、甲硝哒唑 (VAM)处理小鼠，以及移植P2rx7-/-小鼠盲肠的内容物前后小鼠的各种指标的变化，发现 P2rx7-/-小鼠导致脂肪沉积和代谢功能异常，粪便移植恢复Tfh细胞丰度，Tfh细胞通过控制 IgA的分泌来促进产生健康的肠道微生态。
Tfh细胞中的P2X7受体对于塑造肠道微生物群是很重要的，缺乏P2X7导致肠道中致肥胖的微生物选择性增加，Tfh细胞控制IgA的分泌来促进产生健康的肠道微生态，且P2X7受体识别细菌产 生的ATP，从而促进形成有利于宿主代谢稳态的肠道生态系统。
Lisa Perruzza, Giorgio Gargari, Michele Proietti, et al. T Follicular Helper Cells Promote a Beneficial Gut Ecosystem for Host Metabolic Homeostasis by Sensing Microbiota-Derived Extracellular ATP. Cell Reports , 2017.
